MEDAFCO Développement est structurée en deux organes :
1) Le Conseil des Mentors
Il a pour mission de :
- Orienter la stratégie de l'organisation
- Veiller au respect continu des valeurs fondamentales de MEDAFCO Développement
2) L'Equipe Exécutive
Elle a pour mission de :
- Elaborer le programme d'action de l'organisation sur la base des besoins et priorités des acteurs du développement
- Mettre en oeuvre le programme de l'organisation après sa validation par le Conseil des Mentors